Iako je tražio da kaznu izdržava iza mostarskih rešetaka, njegova žalba i zahtjev su odbijeni pa će sedmogodišnju robiju morati izdržavati u Kazneno-popravnom zavodu u Zenici.
Lider stranke Radom za boljitak je prvobitno osuđen na 9 godina zatvora za zloupotrebu položaja i ovlasti, a u vezi s nezakonitostima prilikom dodjele poticaja poljoprivrednicima na području Tuzle i Federacije BiH u vremenskom periodu od 2011. do kraja 2014. godine.
Sudski postupak u ovom predmetu je počeo u maju 2016. godine, a Lijanović je bio optužen da je budžet FBiH oštetio za više od 817.000 KM, tako što je uslovljavao poljoprivrednike u FBiH da 50 posto od iznosa podsticaja koji im bude dodijeljen moraju davati njegovoj kriminalnoj grupi koju je organizirao.
Tokom suđenja su priloženi brojni materijalni dokazi, a saslušan je i veliki broj svjedoka Tužilaštva TK, među kojima su bili i pripadnici Lijanovićeve kriminalne grupe i članovi Narodne stranke Radom za Boljitak.
Vrhovni sud FBiH djelomično je uvažio žalbu u slučaju Jerka Ivankovića Lijanovića, te smanjio kaznu sa devet na sedam godina zatvora za zloupotrebu položaja u julu 2019. godine.
Od nekadašnjeg ministra poljoprivrede, vodoprivrede i šumarstva Jerka Ivankovića Lijanovića bit će oduzeto 652.861,38 KM, a tom odlukom zabranjeno mu je obavljanje ministarske dužnosti do 2021. godine.
Bivši ministar u Vladi FBiH Jerko Ivanković Lijanović u sudskom postupku je negirao krivicu.
Protiv Jerka Ivankovića Lijanovića i još osam osoba je u Sudu BiH u toku i obnovljeni postupak nakon što je ukinuta prvostepena presuda kojom su zbog organizovanog kriminala, pranja novca, poreznih utaja te krivotvorenja ili uništenja poslovnih knjiga ili isprava osuđeni na ukupno 52 godine i osam mjeseci zatvora.